Ciri khas kurikulum pendidikan di Pondok Pesantren Manba’ul ‘Ulum Cirebon yaitu memadukan sistem Tarbiyatul Mu’allimien wal Mu’allimat Al-Islamiyah (TMI) dan Sistem sekolah SMP-MTs dan SMA-MA.
Berikut jenjang pendidikannya:
- Program 6 (enam) tahun untuk lulusan SD/MI
- Program 3 (tiga) tahun untuk lulusan SMP/MTs